Descifrar la información del genoma de la palma de aceite. - (:unkn) unknown (My University)
Un modesto comienzo para usar la tecnología genómica en la palma de aceite se realizó con la secuenciación de clones de adn complementario (adnc) como marcadores de secuencias expresadas (est, por su sigla en inglés). Con este método de descubrimiento rápido de genes, el mpob generó más de 17.000 est para la palma de aceite. Los est demostraron ser valiosos como fuente de marcadores moleculares, con aplicación potencial para el mejoramiento genético de la palma de aceite y el cultivo de tejidos. En el esfuerzo para asignar funciones a los genes descubiertos en la palma de aceite, se inició también un programa de microarreglos de adn. El est y otras secuencias clonadas del gen de la palma de aceite se imprimieron en microarreglos o chips de adn, y se estudiaron sus posibles funciones en diversos tejidos y fases de desarrollo, especialmente durante el cultivo de tejidos de la palma de aceite. Para sobreponerse a las deficiencias asociadas con los est, la mpob también inició un proyecto para generar la primera colección completa de secuencias de genes de un cultivo oleaginoso mediante la secuenciación de las regiones hipometiladas del genoma de la palma de aceite, empleando la técnica de filtración de metilación GeneThresherTM. Más de 400.000 secuencias se generaron de nueve palmas individuales. También se minaron y se emplearon marcadores microsatelitales (repeticiones de secuencia simple, ssr, por su sigla en inglés) y polimorfismos de un solo nucleótido (snp, por su sigla en inglés) para construir mapas genéticos de alta densidad de la palma de aceite. A fin de obtener una cobertura más completa del genoma, el mpob emprendió la secuenciación del genoma y del transcriptoma de la palma de aceite mediante el empleo de tecnologías de secuenciación de próxima generación (ngs, por su sigla en inglés). Asimismo se continúa activamente con la investigación citogenética molecular para obtener un panorama completo de la estructura y organización del genoma de la palma de aceite.
Un modesto comienzo para usar la tecnología genómica en la palma de aceite se realizó con la secuenciación de clones de adn complementario (adnc) como marcadores de secuencias expresadas (est, por su sigla en inglés). Con este método de descubrimiento rápido de genes, el mpob generó más de 17.000 est para la palma de aceite. Los est demostraron ser valiosos como fuente de marcadores moleculares, con aplicación potencial para el mejoramiento genético de la palma de aceite y el cultivo de tejidos. En el esfuerzo para asignar funciones a los genes descubiertos en la palma de aceite, se inició también un programa de microarreglos de adn. El est y otras secuencias clonadas del gen de la palma de aceite se imprimieron en microarreglos o chips de adn, y se estudiaron sus posibles funciones en diversos tejidos y fases de desarrollo, especialmente durante el cultivo de tejidos de la palma de aceite. Para sobreponerse a las deficiencias asociadas con los est, la mpob también inició un proyecto para generar la primera colección completa de secuencias de genes de un cultivo oleaginoso mediante la secuenciación de las regiones hipometiladas del genoma de la palma de aceite, empleando la técnica de filtración de metilación GeneThresherTM. Más de 400.000 secuencias se generaron de nueve palmas individuales. También se minaron y se emplearon marcadores microsatelitales (repeticiones de secuencia simple, ssr, por su sigla en inglés) y polimorfismos de un solo nucleótido (snp, por su sigla en inglés) para construir mapas genéticos de alta densidad de la palma de aceite. A fin de obtener una cobertura más completa del genoma, el mpob emprendió la secuenciación del genoma y del transcriptoma de la palma de aceite mediante el empleo de tecnologías de secuenciación de próxima generación (ngs, por su sigla en inglés). Asimismo se continúa activamente con la investigación citogenética molecular para obtener un panorama completo de la estructura y organización del genoma de la palma de aceite.
Keywords: Genomas.; Mejoramiento genético; Marcadores moleculares