| dc.creator | Singh, Rajinder | |
| dc.creator | Low Eng Ti, Leslie | |
| dc.creator | Madon, Maria | |
| dc.creator | Ong Abdullah, Meilina | |
| dc.creator | Ooi Cheng- Li, Leslie | |
| dc.creator | Pek Lan, Chan | |
| dc.creator | Sambanthamurthi, Ravigadev | |
| dc.date | 2013-01-01 | |
| dc.date.accessioned | 2020-07-25T11:20:28Z | |
| dc.date.available | 2020-07-25T11:20:28Z | |
| dc.identifier | https://publicaciones.fedepalma.org/index.php/palmas/article/view/10678 | |
| dc.identifier.uri | http://repositorio.fedepalma.org/handle/123456789/140256 | |
| dc.description | Un modesto comienzo para usar la tecnología genómica en la palma de aceite se realizó con la secuenciación de clones de ADN complementario (ADNC) como marcadores de secuencias expresadas (EST, por su sigla en inglés). Con este método de descubrimiento rápido de genes, el MPOB generó más de 17.000 EST para la palma de aceite. Los EST demostraron ser valiosos como fuente de marcadores moleculares, con aplicación potencial para el mejoramiento genético de la palma de aceite y el cultivo de tejidos. En el esfuerzo para asignar funciones a los genes descubiertos en la palma de aceite, se inició también un programa de microarreglos de ADN. El EST y otras secuencias clonadas del gen de la palma de aceite se imprimieron en microarreglos o chips de ADN, y se estudiaron sus posibles funciones en diversos tejidos y fases de desarrollo, especialmente durante el cultivo de tejidos de la palma de aceite. Para sobreponerse a las deficiencias asociadas con los EST, la MPOB también inició un proyecto para generar la primera colección completa de secuencias de genes de un cultivo oleaginoso mediante la secuenciación de las regiones hipometiladas del genoma de la palma de aceite, empleando la técnica de filtración de metilación GeneThresherTM. Más de 400.000 secuencias se generaron de nueve palmas individuales. También se minaron y se emplearon marcadores microsatelitales (repeticiones de secuencia simple, SSR, por su sigla en inglés) y polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, por su sigla en inglés) para construir mapas genéticos de alta densidad de la palma de aceite. A fin de obtener una cobertura más completa del genoma, el MPOB emprendió la secuenciación del genoma y del transcriptoma de la palma de aceite mediante el empleo de tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS, por su sigla en inglés). Asimismo se continúa activamente con la investigación citogenética molecular para obtener un panorama completo de la estructura y organización del genoma de la palma de aceite. | es-ES |
| dc.description | A modest start to using genomics technology in oil palm was made with the sequencing of complementary DNA (c DNAS) clones as expressed sequence tags (ESTS). This method of rapid gene discovery led to more than 17.000 ESTS generated for oil palm by MPOB. The ESTS proved to be valuable as a source of molecular markers with potential application in oil palm breeding and tissue culture. In the effort to assign functions to the genes discovered in oil palm, a DNA microarray programme was also initiated. The ESTS and other cloned oil palm gene sequences were printed on DNA microarrays, or chips, and their possible functions in various tissues and developmental phases especially during oil palm tissue culture were studied. To overcome the shortcomings associated with ESTS, MPOB also launched an effort to generate the first comprehensive collection of gene sequences of an oil crop by sequencing the hypomethylated regions of the oil palm genome using the GeneThresherTM methylation filtration technique. Over 400.000 sequences were generated from nine individual palms. Simple sequence repeat (SSR) and single nucleotide polymorphism (SNP) markers were also mined and used to construct high density genetic maps for oil palm. In order to obtain a more comprehensive coverage of the genome, MPOB has embarked on sequencing of the oil palm genome and transcriptome using the next generation sequencing (NGS) technologies. Molecular cytogenetics research is also being actively pursued to obtain a complete picture of the oil palm genome structure and organization. | en-US |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | spa | |
| dc.publisher | Fedepalma | es-ES |
| dc.relation | https://publicaciones.fedepalma.org/index.php/palmas/article/view/10678/10663 | |
| dc.rights | Derechos de autor 2017 Revista Palmas | es-ES |
| dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 | es-ES |
| dc.source | Revista Palmas; Vol. 34 (2013): No Especial, tomo I; 153-160 | es-ES |
| dc.source | 0121-2923 | |
| dc.subject | genome | en-US |
| dc.subject | DNA | en-US |
| dc.subject | molecular markers | en-US |
| dc.subject | Expressed Sequence Tags (EST) | en-US |
| dc.subject | breedin | en-US |
| dc.subject | Genoma | es-ES |
| dc.subject | ADN | es-ES |
| dc.subject | marcadores moleculares | es-ES |
| dc.subject | marcadores de secuencias expresadas (SET) | es-ES |
| dc.subject | mejoramiento genético | es-ES |
| dc.title | Descifrar la información del genoma de la palma de aceite | es-ES |
| dc.title | Deciphering the Oil Palm Genome Information | en-US |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | |
